Protein tozu çeşitli kaynaklardan üretilebilmektedir. Örneğin peynir altı suyundan üretilen whey protein, peynir üretiminde bir yan ürün olarak oluşan peynir altı suyunun çeşitli filtrasyon işlemlerinden geçirilmesi ve kurutulması ile elde edilirken, soya proteini ise soya fasulyesinin çeşitli pişirme ve filtrasyon işlemleri ile tüm karbonhidrat ve yağlarından arındırılması ile elde edilir.